与武汉发现的病毒相比,患者A的病毒核苷酸序列有58个替换,39个缺失,9个插入(基因组覆盖率99.62%),属于Pango系BA.1(别名为B.1.1.529.1)。由于低病毒载量,患者B病毒基因组的覆盖率仅为92.62%。根据检测到的50个替换和3个缺失的特点,患者B的菌株属于B.1.1.529。继Alpha、Beta、Gamma和Delta变种之后,世界卫生组织(WHO)将B.1.1.529及其后代(BA.1和BA.2)指定为第五个SARS-CoV-2变种(VOC),命名为Omicron(奥密克戎)。南非于2021年11月24日首次向世卫组织报告了奥密克戎变异株。截至2021年12月14日,55个国家在全球共享流感数据倡议组织(GISAID)上传了4265个奥密克戎基因组序列。
从患者A和患者B菌株的刺突蛋白中分别检测到40个氨基酸突变位点和至少26个氨基酸突变位点。受体结合域和furin蛋白酶切位点附近的一些突变,可能与免疫逃逸增强或传染性增高相关。
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如今,奥密克戎在世界上多个国家都显示出了比其他变体更快的增长趋势。此外,初步实验数据表明,奥密克戎显示出对疫苗的免疫保护降低。
《周报》指出,天津两例病例发现的菌株是大陆首次发现的输入型奥密克戎变异株,对我国新冠肺炎疫情防控构成巨大潜在威胁。奥密克戎的传播力、致病性和免疫逃逸能力亟待进一步研究。