指挥中心6月21日通报称，基于近期苗栗县有电子厂移工群聚感染案件，台劳动部门再强化移工（外籍劳工）工作及生活住宿管理，明定部分指引内容具有强制性质，后续将配合法规修正，要求雇主落实防疫措施，避免发生防疫破口。雇主在疫情期间，未依指引规范妥善办理，将视情节轻重，要求雇主限期改善，或处新台币6万至30万元罚款；此外，违规情节重大者，将再针对聘雇移工名额予以废止或不予许可。
指挥中心规定，疫情期间雇主应办理措施，包括移工的工作区及生活区应分舱分流，同产线移工应住宿于同一地点；不同雇主的移工不得混住、公共区域应依照移工住宿楼层分时段使用、每天进行移工健康监测及记录移工出入足迹、接触史与是否群聚等资料，并应备有1人1室隔离空间等。
此外，据新华社6月20日消息，台湾军方桃园总医院暴发院内群聚感染事件。桃园市政府介绍，目前该医院包括2名护理师、2名家属及4名病患、5名看护共13人确诊染疫。该院停止3天门诊和急诊，全院人员全部采检。
台当局教育主管部门公布，4月20日到6月19日17时30分，全台各级学校合计600人确诊新冠肺炎，其中以大专院校确诊202人最多，高中96人、初中93人、小学143人及幼儿园66人。
